כימואינפורמטיקה
כִימוֹאִינְפוֹרְמָטִיקָה (באנגלית: Cheminformatics) עוסקת ביישום של כלים מתחום מדעי המחשב, המתמטיקה, הסטטיסטיקה ותורת המידע כדי לפתור בעיות בכימיה ולעבד מידע כימי רחב היקף. זהו אחד מענפי הכימיה התאורטית המעורב במחקר של אובייקטים של מרחב כימי. כימואינפּורמטיקה מכסה את הייצוג, אחסון, ניהול, ניתוח ושימוש במידע כימי.
יסודות
עריכהכימואינפּורמטיקה ממוקמת בצומת של כימיה ומדעי המחשב. בליבה של כימואינפּורמטיקה הוא מושג של מרחב כימי - מכלול של כל האובייקטים הכימיים (תרכובות, תגובות כימיות, זרזים, תערובות, תמיסות, חומרים טבעיים וסינתטיים וכו'). בכימואינפּורמטיקה חיזוי תכונות של אובייקטים כימיים מתבצעת על ידי העברת ערכי תכונות ידועות של אובייקטים כימיים דומים. ברוב המקרים, ניתן לתאר אובייקטים כימיים באמצעות גרפים מולקולריים, ולכן שיטות של תורת הגרפים נמצאות בשימוש נרחב בכימואינפּורמטיקה. הגישה המסורתית לעיבוד מידע כימי היא לחשב את הווקטורים של מתארים (descriptors) עבור כל אובייקט כימי. זה מאפשר ליישם שיטות של סטטיסטיקה מתמטית ולמידה חישובית לעיבוד מידע כימי.
מטרות ושימושים
עריכה- הקמת בסיסי נתונים של תרכובות ותגובות כימיות
- פיתוח שיטות אחזור, אחסון ועיבוד של מידע כימי
- חיזוי תכונות פיזיקליות וכימיות ופעילויות ביולוגיות של תרכובות כימיות
- ההמצאה של תרכובות וחומרים כימיים חדשים בעלי תכונות שנקבעו מראש
- החיפוש אחר תרופות חדשות
- ויזואליזציה של מרחב כימי
- אחסון וניתוח של מידע ספקטרלי
- חיזוי של תגובות כימיות
- תכנון של סנתזה אורגנית
ראו גם
עריכהלקריאה נוספת
עריכהספרי לימוד
עריכה- A.R. Leach, V.J. Gillet An Introduction to Chemoinformatics. Springer, 2003
- J. Gasteiger (Ed.), T. Engel (Ed.) Chemoinformatics : A Textbook. John Wiley & Sons, 2004
ספרים
עריכה- J. Gasteiger (Ed.) Handbook of Chemoinformatics. From Data to Knowledge. Wiley-VCH, Weinheim, 2003, in 4 volumes
- J. Bajorath Chemoinformatics: Concepts, Methods, and Tools for Drug Discovery, Humana Press: Totowa, New Jersey, 2004
- T.I. Oprea Chemoinformatics in Drug Discovery, Wiley-VCH, 2005
- A. Varnek (Ed.), A. Tropsha (Ed.) Chemoinformatics Approaches to Virtual Screening, RSC Publishing, 2008
מאמרים עיקריים
עריכה- F. Brown (1998). «Chapter 35. Chemoinformatics: What is it and How does it Impact Drug Discovery». Annual Reports in Med. Chem. 33: 375
- F. Brown (2005). «Editorial Opinion: Chemoinformatics – a ten year update». Current Opinion in Drug Discovery & Development 8 (3): 296–302
- A. Varnek, I. Baskin (2011). «Chemoinformatics as a Theoretical Chemistry Discipline». Molecular Informatics 30 (1): 20-32
